涉台文物、工业遗产、乡土建筑、20世纪遗产、文化景观等新类型文化遗产在这次文物普查中得到充分重视。宁化陈塘红军旧址、武夷山黄柏竹林坑遗址和建殴黄村值庆桥被国家文物局评为第三次全国文物普查百大新发现；厦门抗战时期金门县政府办公旧址等14处文物，被列入2008年度和2009年度第三次全国文物普查重要新发现。